EMBL udostępnia nowe zasoby dla badaczy w dziedzinie nauk biologicznych

Europejskie Laboratorium Biologii Molekularnej EMBL uruchomiło bezpłatne zasoby internetowe nazwane CiteXplore, łączące literaturę naukową z bazami danych z dziedziny biologii. Zdaniem projektantów CiteXplore w naukach biologicznych od dawna brakowało narzędzia łączącego artykuły z czasopism naukowych z bazami danych zawierającymi informacje z dziedziny biologii, takie jak sekwencje DNA i białek, funkcje i struktury cząsteczek i dane o mikromatrycach.

– Kiedy czyta się streszczenie artykułu opisujące konkretny gen lub białko,
zwykle chce się dowiedzieć więcej o nim, na przykład o jego sekwencji lub
funkcji, a także uzyskać łatwy dostęp do całego artykułu – wyjaśnił Peter Stoehr,
koordynujący CiteXplore.

CiteXplore opracowano w Europejskim Instytucie Bioinformatyki (EBI) należącym do
EMBL. Gromadzi się tam streszczenia artykułów z wielu baz danych o zawartości
literatury, w tym Europejskiej Organizacji Patentowej, bazy danych MEDLINE
amerykańskiej Narodowej Biblioteki Medycznej (National Library of Medicine) oraz
Chińskiej Akademii Nauk. Następnie system łączy te streszczenia z pełnymi
tekstami artykułów.

Potężne narzędzie eksplorujące teksty wyszukuje w tekście terminy biologiczne i
łączy je bezpośrednio z odpowiednim hasłem w obszernych bazach danych z
dziedziny biologii EBI. Wśród nich jest należąca do EMBL baza danych sekwencji
nukleotydów (Nucleotide Sequence Database), obejmująca sekwencje DNA i RNA, baza
UniProt, zawierająca informacje na temat struktury i funkcji białek oraz
ArrayExpress, zawierająca informacje o sposobach ekspresji genów.

Planuje się poszerzenie zakresu ujętych w CiteXplore zasobów literatury o
dziedziny takie jak botanika, nauki rolnicze i o żywności oraz zintegrowanie jej
z uruchomionym niedawno brytyjskim projektem PubMedCentral.

EBI jest największą w Europie instytucją upowszechniającą informacje z dziedziny
biologii. Fakt ten został niedawno podkreślony w planie Europejskiego Forum
Strategicznego Infrastruktur Badawczych.

Więcej informacji na temat CiteXplore znajduje się na stronie

Źródło danych: Europejskie Laboratorium Biologii Molekularnej (EMBL)/CORDIS